Hijo de los señores Antonio Encarnación Manzueta y María Ramírez. Nació en Yamasá, Monte Plata, hacia el año 1823.
Tuvo una participación muy destacada en la Independencia Nacional, del 27 de Febrero de 1844, en su región de Yamasá. Allí apoyó a los trinitarios.
Fue amigo de Pedro Santana Familia y estuvo bajo su mando en la Guerra de Independencia de 1844, donde alcanzó el rango de Coronel de Milicias.
Eusebio Manzueta casó con Regina Benigna de la Rosa y tuvieron nueve hijos : Celedonio, Petronila, María Fundadora, Marcelino, Angel María, Eusebio, María, Clemencia y Silvano Manzueta de la Rosa.
Apoyó en principio la Anexión del país a España, proclamada por su amigo Pedro Santana, el 18 de marzo de 1861.
Cuando se produce el grito de Capotillo, el 16 de agosto de 1863, se pone a la disposición de éstos y apoyó dicho movimiento desde el Cantón de Yamasá.
Manzueta muy pronto se convirtió en Jefe de la Línea del Este y participó en muchas acciones de peligros, saliendo victoriosos.
En el año 1864 el Gobierno Restaurador lo designó como Jefe Supremo de la región Este del país.
Cuando fue derrotado el Gobierno del general Pedro Antonio Pimentel en 1865, el general Eusebio Manzueta ocupó provisionalmente la presidencia de la República por algunos días.
Apoyó el movimiento en apoyo de José María Cabral, para designarlo como Protector de la República, en 1865.
Combatió al Gobierno de los seis años de Buenaventura Báez, su acérrimo enemigo.
El general Eusebio Manzueta, murió fusilado en la ciudad de Puerto Plata, el 12 de noviembre de 1873.
Mediante el decreto No. 2140, del 1972, el Poder Ejecutivo, ordenó el traslado de los restos del general Eusebio Manzueta en el Panteón Nacional, aún éstos no han sido depositado en aquel sagrado Templo.